Esencijalni metalni ioni u proteinima iz Heliobacter pylori i modelnim spojevima-struktura u funkcija/svojstvo

Opis projekta
Unutar ovog projekta strukturno ćemo karakterizirati nekoliko proteina iz Helicobacter pylori (i otkriti njihove funkcije) i modele kompleksa malih molekula esencijalnih metalnih iona s biološki važnim ligandima (i pronaći njihova svojstva). Prioritet će biti esencijalni metali koji su uključeni u metaloproteine ​​H. pylori. Svjetska zdravstvena organizacija proglasila je H. pylori kancerogenom klasom 1 i važna je meta za istraživanje zbog svoje patološke važnosti. H. pylori zahtijeva nekoliko pomoćnih bjelančevina poput HypA i HypB za pravilnu izgradnju [Ni, Fe] hidrogenaze i ureaze. Planiramo klonirati, eksprimirati, pročistiti i karakterizirati kompleks HypA-HypB i proteine ​​CrdA i CrdB biofizičkim i strukturnim metodama (analiza toplinske stabilnosti, kružni dikroizam, određivanje konstante disocijacije bakrenih iona, difrakcija X-zraka, 3D NMR). Nadamo se da ćemo utvrditi kako metalohaperoni izvršavaju svoje funkcije u unutarstaničnoj isporuci nikla (HypA-HypB) i mehanizam regulacije razine bakra (CrdA, CrdB). Cilj proučavanja modela kompleksa (s bakrom, niklom, željezom, cinkom i drugim bitnim metalnim ionima) je utvrditi kako ti metali oblikuju svoje koordinacijsko okruženje aminokiselinama i njihovim derivatima (N-alkilirani, amidi, peptidi, metionin -bogati peptidi i drugi) i za dobivanje informacija o specifičnosti aminokiselina ili kratkih peptidnih bočnih lanaca prema različitim metalnim ionima. Kompleksi će se sintetizirati i strukturno karakterizirati termičkom i spektroskopskom analizom i eksperimentima difrakcije kristalne strukture X-zraka. Izgradit će se konformacije bakrenih kompleksa s aminokiselinama i optimizirati geometrija za proučavanje njihovih mogućih ravnotežnih geometrija kvantno-kemijskim proračunima.

Akronim
ProtModStruct

Šifra projekta
IP-2014-09-4274

Poziv
2014-09

Vrsta projekta
Znanstveno-istraživački

Vrsta financiranja
Kompetitivno projektno financiranje

Financijer
HRZZ - Hrvatska zaklada za znanost

Detalji financiranja
 IP - Istraživački projekti

Ukupan iznos financiranja projekta
970.000,00 HRK

Trajanje projekta
01-06-2015 - 31-05-2019

Ustanova - uloga
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Nositelj (970.000,00 HRK) [01-06-2015 - 31-05-2019]

Osoba - Ustanova - uloga [pocetak - zavrsetak]
Dubravka Matković-Čalogović (MBZ: , CROSBI: ) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Voditelj projekta [01-06-2015 - 31-05-2019]
Biserka Prugovečki (MBZ: 217444, CROSBI: 16221) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Ivica Đilović (MBZ: 266272, CROSBI: 21759) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Nenad Judaš (MBZ: 210286, CROSBI: 15753) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Draginja Mrvoš-Sermek (MBZ: 11941, CROSBI: 11832) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Ivana Kekez (MBZ: 326116, CROSBI: 30656) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Mario Kekez (MBZ: 351851, CROSBI: 33122) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Neven Smrečki (MBZ: 310864, CROSBI: 26990) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Marina Tašner (MBZ: 221731, CROSBI: 16509) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Kristina Smokrović (MBZ: 357374, CROSBI: 33714) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Darko Vušak (MBZ: 348521, CROSBI: 32809) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Ivana Biljan (MBZ: 266235, CROSBI: 21658) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]
Dalibor Milić (MBZ: 266294, CROSBI: 21997) - Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb - Suradnik [01-06-2015 - 31-05-2019]